Stéphane Lacroix devient docteur en science politique en 2007 (Sciences Po), après deux maitrises, l’une en langue et civilisation arabes à l’INALCO et l’autre en mathématiques à l’université Paris 6. En 2008, il reçoit le prix de thèse de l’Association française de sciences sociales des religions.
Il a été chercheur post-doctorant à l’université de Stanford (Abbassi Program in Islamic Studies/Department of Political Science) en 2008-2009 et chercheur invité au Centre d’études et de documentation économiques, juridiques et sociales du Caire entre 2010 et 2013.
Actuellement, il est professeur associé à l’Ecole des affaires internationales de Sciences Po (PSIA)